计算机辅助药物设计
根据您的需求定制!
通过 Enamine 计算机辅助药物发现服务探索新的领域。与我们经验丰富的团队合作,他们擅长使用最前沿的化学信息学和建模工具构建专门的工作流程。我们认为,化学家、生物学家和化学信息学家之间的紧密协作是成功的关键。因此,我们的各部门密切合作,以显著提高药物发现项目的效率。我们的 CADD 团队提供全面的解决方案,帮助您高效地在 Enamine 化合物库中进行击中发现和 Hit-to-Lead 优化。
我们使用哪些工具?
目标建模
分子动力学(MD)模拟
- 有无配体情况下结构行为的时间演变比较
- 模拟突变对蛋白质稳定性、活性以及对已知结合剂耐药性的影响。
- 虚拟筛选选定配体的验证
- 蛋白-配体结合能估算
- 隐秘口袋搜索
同源建模
- 预测目标蛋白的三维结构
- 结构修复
- 突变体建模
目标结构分析
- 潜在结合位点搜索
- 活性残基估算
DNA/RNA 复合物建模
- RNA 凹槽中的插入与结合
- G-四链体(G-quadruplex)建模
- 核糖开关(Riboswitches)建模
- DNA GG 和 GA 结合口袋研究
配体搜索
类似物搜索
- 2D 搜索(如 Morgan Fingerprints、ECFPs 等)
- 3D 搜索(如 Electroshape, USRCAT, E3FP 等)
- 多样化搜索
- BM 骨架搜索、子结构搜索、合成子搜索
虚拟筛选
- 非共价分子对接
- 共价分子对接
- 三维药效团筛选
机器学习(ML)建模与预测
- ML 助力的高通量虚拟筛选
- ML 辅助的 QSAR 模型构建
- ML 驱动的 ADMET 特性预测
Hit-to-Lead 综合项目支持
- 合成可行性评估和筛选结果分析
- 重新构建骨架(Re-scaffolding)
- 生物电子等排替换(Bioisosteric Replacement)
我们采用平衡的方法,综合运用多种互补的技术和策略
由计算机辅助药物设计驱动的生物学验证
- 最短化合物交付时间(1-2 天)
- 访问费用享受 25% 折扣
- 定制工作流满足您的需求
- CADD 和生物学服务享受 10% 折扣
- 高概率获得多达 15 个生物学验证的命中化合物(35-75 个工作日内)
Hit-to-Lead 优化服务
- 活性与非活性化合物的物理化学性质比较与分析
- 对活性和非活性化合物进行聚类,以便进一步分析它们之间的相似性和差异
- 基于实验生物数据构建对接模型,并建立高效的筛选管线,用于验证和优化命中化合物
- 对结构相似但活性不同的化合物进行成对比较,识别关键的区别因素
- 通过 MD 模拟研究蛋白质-配体复合物随时间的变化,评估相互作用的稳定性
2023 年项目组合概览
项目在各大洲的分布
57 个项目和 6 项合作,在这里通过具体的案例研究来深入了解我们的经验和成功。