计算机辅助药物设计

根据您的需求定制!

通过 Enamine 计算机辅助药物发现服务探索新的领域。与我们经验丰富的团队合作,他们擅长使用最前沿的化学信息学和建模工具构建专门的工作流程。我们认为,化学家、生物学家和化学信息学家之间的紧密协作是成功的关键。因此,我们的各部门密切合作,以显著提高药物发现项目的效率。我们的 CADD 团队提供全面的解决方案,帮助您高效地在 Enamine 化合物库中进行击中发现和 Hit-to-Lead 优化。

我们使用哪些工具?

目标建模

分子动力学(MD)模拟

  • 有无配体情况下结构行为的时间演变比较
  • 模拟突变对蛋白质稳定性、活性以及对已知结合剂耐药性的影响。
  • 虚拟筛选选定配体的验证
  • 蛋白-配体结合能估算
  • 隐秘口袋搜索

同源建模

  • 预测目标蛋白的三维结构
  • 结构修复
  • 突变体建模

目标结构分析

  • 潜在结合位点搜索
  • 活性残基估算

DNA/RNA 复合物建模

  • RNA 凹槽中的插入与结合
  • G-四链体(G-quadruplex)建模
  • 核糖开关(Riboswitches)建模
  • DNA GG 和 GA 结合口袋研究

配体搜索

类似物搜索

  • 2D 搜索(如 Morgan Fingerprints、ECFPs 等)
  • 3D 搜索(如 Electroshape, USRCAT, E3FP 等)
  • 多样化搜索
  • BM 骨架搜索、子结构搜索、合成子搜索

虚拟筛选

  • 非共价分子对接
  • 共价分子对接
  • 三维药效团筛选

机器学习(ML)建模与预测

  • ML 助力的高通量虚拟筛选
  • ML 辅助的 QSAR 模型构建
  • ML 驱动的 ADMET 特性预测

Hit-to-Lead 综合项目支持

  • 合成可行性评估和筛选结果分析
  • 重新构建骨架(Re-scaffolding)
  • 生物电子等排替换(Bioisosteric Replacement)

由计算机辅助药物设计驱动的生物学验证

  • 最短化合物交付时间(1-2 天)
  • 访问费用享受 25% 折扣
  • 定制工作流满足您的需求
  • CADD 和生物学服务享受 10% 折扣
  • 高概率获得多达 15 个生物学验证的命中化合物(35-75 个工作日内)

Hit-to-Lead 优化服务

  • 活性与非活性化合物的物理化学性质比较与分析
  • 对活性和非活性化合物进行聚类,以便进一步分析它们之间的相似性和差异
  • 基于实验生物数据构建对接模型,并建立高效的筛选管线,用于验证和优化命中化合物
  • 对结构相似但活性不同的化合物进行成对比较,识别关键的区别因素
  • 通过 MD 模拟研究蛋白质-配体复合物随时间的变化,评估相互作用的稳定性

2023 年项目组合概览

项目在各大洲的分布

57 个项目和 6 项合作,在这里通过具体的案例研究来深入了解我们的经验和成功。