微管蛋白化合物库
潜在微管蛋白配体库
3 200 种化合物
微管蛋白靶向库采用不同方法的组合设计，包括分子对接、子结构和相似性搜索、拓扑类似物查找、分子参数限制和专门开发的结构过滤器。
微管蛋白库以预装板格式提供，也可按客户定制的格式快速提供。
典型格式
微管蛋白化合物库可以提供各种预装板（pre-plated）格式，包括以下最受欢迎的几种：
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| TBL-3-0-Z-10 | 3 200 3块板 |
≤300nL@10mM DMSO溶液 |
1536孔Echo LDV微孔板 前4列和后4列留空，每板1280个化合物 |
立即询价 |
| TBL-3-10-Y-10 | 3 200 10块板 |
10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔LDV微孔板，Echo认证#001-12782 (LP-0200) 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| TBL-3-50-Y-10 | 3 200 10块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
384孔板（Greiner Bio-One plates #781280） 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
* 我们很乐意以最方便您项目的格式提供我们的化合物库。请在以下我们标准的微孔板中进行选择：Greiner Bio-One 781270、784201、781280、651201 或 Echo Qualified 001-12782 (LP-0200)、001-14555 (PP-0200)、001-6969 (LP-0400)、C52621，或者您可以提供您偏好的实验器具。如需化合物混合池，我们也可以根据要求提供。
库的设计
考虑和分析了最近在 PDB 中记录的最适合进行计算机筛选的蛋白质结构：4YJ2、5C8Y、5CA1。这三种微管蛋白结构的结合位点中蛋白质-配体相互作用的主要特征非常相似，并且可以叠加。因此，基于结合口袋中关键氨基酸残基的特征和在分析蛋白质结构中观察到的配体相互作用，构建了蛋白质对接模型。
对接模型已使用一组已知活性（110 个配体）和非活性分子的参考集进行了验证。根据参考化合物集的活性数据进行了计算约束的修正。
图 1.对接计算后命中结合确认的示例
图 2.高对接得分的命中化合物 Z666232790 的 2D 配体相互作用图
2D相似性搜索和拓扑类似物搜索
- 参考化合物集是经过精心编纂，来源于现有的文献资料和数据库，包括 ChEMBL、BindingDB 和 PudChem。
- 使用 Tanimoto 相似度范围 95-80% 进行化合物筛选。
- 使用拓扑场和生物电子等排基团替代来寻找最有效的微管蛋白抑制剂的类似物。
活性分子示例
使用这种方法筛选出了约 900 种化合物。
微管蛋白靶向库中的分子示例
应用于该化合物库的过滤器
- 应用了内部开发的药物化学过滤器，用于对 Enamine 库存化合物集进行预选。
- 包括 PAINS、Eli Lilly、REOS 和常见功能性基团过滤器。
- 完全符合五原则（Rule of Five）。
