PPI 片段库
能够模拟蛋白质的结构基序和热点残基的片段
3 600 种化合物
蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interactions, PPI）调节了生命周期的大多数方面，因此成为当代药物开发中最具吸引力和前景的目标之一。然而，这一领域仍有许多未被充分探索的地方，涉及 PPI 的蛋白质没有共同的规则。传统的高通量筛选方法和算法在应对这些复杂的生物系统时成本效益不高。然而，基于片段的方法在寻找新的 PPI 抑制剂方面取得了显著成果。为此，我们创建了一个新的 PPI 片段库，该库的设计结合了对常见 PPI 抑制剂的系统性知识和特权结构基序的选择。
使用我们的 PPI 片段进行命中查找，可以显著节省时间和成本，特别是在先导化合物生成阶段。库中的每个片段都有丰富的库存类似物，可以直接用于进一步的优化和验证。如果需要，可以通过 REAL Database 技术快速合成新的衍生物，确保快速获得所需的化合物。
典型格式
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| PPIF-3600-Y-10 | 3 600 10块板 |
10µL@10mM DMSO-d6储备溶液 |
384孔微孔板（Labcyte#LP-0200）Echo认证 | 立即询价 |
| PPIF-3600-X-50 | 3 600 40块板 |
50µL@10mM DMSO-d6储备溶液 |
96孔板（Greiner) 第1列和最后1列留空，每板80个化合物 |
立即询价 |
| PPIF-3600-X-100 | 3 600 40块板 |
100µL@10mM DMSO-d6储备溶液 |
96孔微孔板 第1列和最后1列留空，每板80个化合物 |
立即询价 |
| PPIF-3600 | 3 600 | 客户定制 | 任意定制形式 | 立即询价 |
下载SD文件
- 库代码：PPIF-3600
- 版本：2021年9月16日
- 3 600 种化合物
- DMSO-d6 溶液中浓度为 40mM
主要特征
近期的研究表明，PPI 片段通常需要更高的分子量，因为它们需要覆盖更大的接触表面积。为了提取初始的 PPI 片段子集，我们采用了“四规则”（Rule of Four）限制，尽管这些片段通常比普通片段更大和更亲脂性。此外，我们还使用机器学习方法（决策树）和多个验证的描述符来进一步精炼库。
“热点”概念已被应用，意味着使用在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）中起关键作用的“关键”氨基酸残基。选定的片段中有相当一部分含有与这些热点基序相对应的基团或部分。此外，库中富集了具有 α 螺旋样结构的分子，这些分子能够模拟蛋白质的结构基序。由于氢键在 PPI 中往往起着至关重要的作用，库中优先选择至少含有一个氢键供体（>70%）和一个氢键受体（100%）的分子。
分子示例
分子特性
