色氨酸代谢途径库
专为发现新型代谢紊乱调节剂而设计
13 120 种化合物
犬尿氨酸是一种代谢通路，它通过色氨酸的降解来产生烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）。这条途径的紊乱与一系列疾病和症状相关，包括感染性疾病（如 HIV）、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病（AD）、亨廷顿病（HD）和肌萎缩侧索硬化症（ALS））、情感障碍（如精神分裂症、抑郁症和焦虑症）、自身免疫性疾病、周围性条件以及恶性肿瘤。我们工作的目标是寻找针对犬尿氨酸途径的新潜在活性化合物，这些化合物可以作为早期药物开发中方便且高质量的起点。
典型格式
色氨酸代谢途径库（Kynurenine Pathway Library）可以提供各种预装板（pre-plated）格式，包括以下最受欢迎的几种：
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| KYN-13-0-Y-10 | 13 120 41块板 |
≤300nL@10mM DMSO溶液 |
1536孔Echo LDV微孔板 前4列和后4列留空，每板1280个化合物 |
立即询价 |
| KYN-13-10-Y-10 | 13 120 41块板 |
≤10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔LDV微孔板，Echo认证#001-12782 (LP-0200) 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| KYN-13-50-X-10 | 13 120 164块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
384孔板（Greiner Bio-One plates #781280） 第1、2和23、24列留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| 化合物库 & 后续跟进包： | KYN-13-10-Y-10 筛选库 13 120 个化合物 hit 再补给，类似物从 440 多万库存中获取或从 REAL 空间合成 |
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* 我们很乐意以最方便您项目的格式提供我们的化合物库。请在以下我们标准的微孔板中进行选择：Greiner Bio-One 781270、784201、781280、651201 或 Echo Qualified 001-12782 (LP-0200)、001-14555 (PP-0200)、001-6969 (LP-0400)、C52621，或者您可以提供您偏好的实验器具。如需化合物混合池，我们也可以根据要求提供。
下载SD文件
- 库代码：KYN-13
- 版本：2023年3月17日
- 13 120 种化合物
- 库代码：IDO-4800
- 版本：2024年8月13日
- 4 800 种化合物在 DMSO 溶液中浓度为 10mM
- 库代码：TDO-5120
- 版本：2024年8月13日
- 5 120 种化合物
- 库代码：KMO-3200
- 版本：2024年8月13日
- 3 200 种化合物
库的设计
潜在活性化合物的搜索时基于以下目标的所有可用蛋白质和配体结构数据进行的：吲哚胺双加氧酶（IDO）、色氨酸双加氧酶（TDO）、3-羟基苯甲酸双加氧酶（3-HAO）、犬尿酸氨基转移酶（KATs）、犬尿氨酸-3-单加氧酶（KMO）。
右图1.犬尿氨酸在哺乳动物中色氨酸降解的途径。
筛选模型的准备和验证
从 PDB 中检索了所有可用的目标的 3D 结构。通过结构的交替对齐和比较显示，RMSD 在 0.4-0.71 Å2 范围内，每个单独的蛋白质目标的序列的一致性>90%。考虑到配体结合参数（蛋白质-天然配体）和结合位点的几何参数，在所有代表性结构中只选择了一个结构用于模型制备。
右图2.IDO1 的结合位点（2D0T（上）、4PK5（下）和用于分子对接的两个主要子口袋（蓝色和黄色））。
分子对接与药效团搜索
基于已知活性化合物和“蛋白质-天然配体”复合物，建立并验证了基于配体（IDO：3，TDO：4，KATs：3，KMO：2）和基于结构（IDO：3，TDO：6，3-HAO：2，KATs：3，KMO：4）的药效团模型。然后对超过 100 万个化合物的药物相似性 Enamine 数据库进行了筛选。
上图 3.分子对接结果：天然配体（灰色）和命中配体（黄色）的叠加，具有基于结构的药效团特征。
分子示例
图 4.用于计算机辅助筛选的基于配体的药效团模型。
分子对接计算和药效团搜索后的靶向库中化合物的数量：
对犬尿氨酸途径中涉及的蛋白质及其配体相互作用进行了仔细分析。使用所有可用的最先进的方法进行迭代计算搜索，以获得独特的潜在活性分子集。通过化学类型控制，用真正阳性结构基团和新的“无专利”结构核心来丰富化合物库。
开发的靶向集合旨在一步到位，高概率地发现针对任何特定靶标的初始 hit。
