IDO 靶向化合物库
通过结构和配体相结合的方法而设计的 IDO 靶向化合物库
4 800 种化合物
吲哚胺 2,3-双加氧酶（IDO）是一种含血红素的蛋白质，可催化色氨酸中吲哚的 C2-C3 双键的氧化裂解，生成 N-甲酰犬尿氨酸。
抑制这一代谢途径对于许多神经退行性疾病的治疗来说前景广阔且极具吸引力，如阿尔茨海默病、帕金森病以及脑缺血等。
此外，IDO1（编码 IDO 的基因）在多种肿瘤细胞中过度表达，因此其被认为是导致肿瘤微环境中癌症免疫抑制的关键因素之一。
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- 库代码：IDO-4800
- 版本：2024年8月13日
- 4 800 种化合物在 DMSO 溶液中浓度为 10mM
库的设计
根据文献数据，IDO 抑制剂与生物靶标的关键相互作用是与活性位点血红素中的铁离子配位。正是这种相互作用阻止了铁离子参与吲哚胺的氧化。
大量已知的 IDO 抑制剂是分子量相对较低的亲水性化合物。因此，在初始化合物集选择中应用了严格的 PhysChem 参数过滤器（先导化合物相似性，Veber 规则）。我们开发了一种整体的化合物库设计方法，包括基于配体/受体的虚拟筛选、血红素结合片段的富集以及新化学类型的选择。
- 基于配体的方法：从我们的库存中挑选出具有类似骨架、化学类型和关键基团的化合物。
- 对接：虚拟筛选是在考虑到血红素配位约束和其它对大多数强效配体特有的重要结构特征下进行的。配体填充周围亚口袋的能力被设定为优选条件。
- 通过子结构搜索进行选择：对含有已报道与血红素形成配位键的片段的分子进行了关键搜索。具有独特化学类型和适当形状的化合物被纳入库中。
- 分子特性：100% 符合 Ro5，99.5% 符合先导化合物相似性。
库中的分子示例
库中包含的螯合片段和使用的参考化合物示例
