表观遗传学化合物库
聚焦靶向多个表观遗传靶点的化合物库
38 080 种化合物
近年来，在表观遗传学领域的发现为除了 DNA 序列之外的遗传信息如何调节生物体功能提供了坚实的分子基础。Enamine 公司很自豪能为我们的客户提供专注于几类表观遗传靶点的化合物库：组蛋白去乙酰化酶（HDACs）、组蛋白甲基转移酶（HMT）、DNA 甲基转移酶（DNMT）、溴结构域。
库的设计
由于表观遗传靶标类别的差异非常大，因此使用了不同的策略创建化合物库。每一类表观遗传靶点都代表不同家族，应分别对待。在创建化合物库时，我们的主要思想是创建针对特定家族的化合物库，而不是针对特定的分子靶点。这一策略基于对来自相似家族的分子靶点按照其结合位点信息进行分类，包括位点的空间结构、氨基酸组成等，从而构建描述靶点家族及其与配体交互特性的概貌。这些数据为选择化合物提供了坚实的基础，这些化合物具有足够的结构性特征以及表现出良好的结合能力。下一步包括创建先进的三维药效团模型，以进一步减少需要进行对接程序的化合物数量。接下来是对所获得的结果进行最终调整和可视化检查。
为每类靶标创建文库时采用了综合方法，其中包括基于配体的方法以及基于受体的方法。因此，通用流程图可以表示如下图：
- 分析所有可用的结构数据（PDB，文献资源等）
- 创建和验证药效团模型
- 使用相互作用关键点、限定体积和空间构象要求进行高级药效团搜索
- 分子对接
- 对获得的结果进行精确调整和可视化检查
这种方法使我们能够创建作为早期研究未充分探索靶点宝贵工具的化合物库，为揭示对靶标具有高亲和力的化合物提供了机会。因此，为进一步的命中探索步骤提供坚实的基础，研究人员可以在这一步骤中专注于增加命中化合物对目标家族其它代表的特异性。
配体-受体相互作用的 HDACs 模式。
