DNA 化合物库

专为鉴定 DNA 稳定性所必需的蛋白质的新活性物质而设计

5 760 种化合物

长期以来，靶向 DNA 仅在非特异性和细胞毒性药物的背景下被考虑。迄今为止，几乎所有已知的 DNA 相互作用药物都会对活细胞造成灾难性作用。几种众所周知的、以前且现在仍然广泛使用的抗癌药物，如顺铂、多柔比星和溴乙锭，都是非选择性 DNA 结合分子或嵌入化合物。在过去的几年里，蛋白质-DNA 相互作用界面在药物研发领域引起了广泛关注。这一领域正处于研究之中，需要大量的深入研究才能将新分子推进至临床阶段。为了满足对新型特异性 DNA 结合分子日益增长的需求，我们构建了一个多功能化合物库，综合运用了多种策略和工具。

该文库已经预装处理，以便最方便、快速地获取。使用我们以 DNA 为重点的化合物库，您可以获得多重益处，从而节省在 hit 扩增和优化方面的时间和成本。

从超过 400 万种化合物的干粉库存中重新供应类似物和 hit 样本
通过我们的 REAL 数据库技术对后续库进行简单、低成本的合成
强化的药物化学支持与全面的 ADME/T 评估

典型格式

DNA 化合物库可以提供各种预装板（pre-plated）格式，包括以下最受欢迎的几种：

目录号	化合物数量	规格	储存形式	价格
DNA-5760-0-Z-10	5 760 5块板	≤300nL@10mM DMSO溶液	1536孔Echo LDV微孔板前4列和后4列留空，每板1280个化合物	立即询价
DNA-5760-10-Y-10	5 760 18块板	≤10µL@10mM DMSO溶液	384孔LDV微孔板，Echo认证#001-12782 (LP-0200) 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物	立即询价
DNA-5760-50-Y-10	5 760 18块板	50μL@10mM DMSO溶液	384孔板（Greiner Bio-One plates #781280）第1、2和23、24列留空，每板320个化合物	立即询价
化合物库 & 后续跟进包：	DNA-5760-10-Y-10 筛选库 5 760 个化合物 hit 再补给，类似物从 440 多万库存中获取或从 REAL 空间合成			立即询价

* 我们很乐意以最方便您项目的格式提供我们的化合物库。请在以下我们标准的微孔板中进行选择：Greiner Bio-One 781270、784201、781280、651201 或 Echo Qualified 001-12782 (LP-0200)、001-14555 (PP-0200)、001-6969 (LP-0400)、C52621，或者您可以提供您偏好的实验器具。如需化合物混合池，我们也可以根据要求提供。

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DNA 化合物库下载

库代码：DNA-5760
版本：2023年10月6日
5 760 种化合物

库的设计

对不同的 DNA 结构进行了仔细的研究和分析：（1）G-四链体结构；G-四链体是非经典的 DNA 结构，由富含鸟嘌呤的序列形成的堆叠 G-四联体组成。这些结构由一价阳离子（如 K+ 和 Na+）稳定。G-四链体常见于 MYC 等致癌基因的启动子区域，在调节基因表达中起重要作用。理解配体与 G-四链体的结合为我们提供了潜在治疗策略，以靶向癌基因和调节基因表达。（2）双螺旋 DNA 结构是两条 DNA 链相互缠绕的基本排列。DNA 双链的完整性对细胞和生物体的稳定性和功能至关重要。DNA 双链断裂是特别严重的事件，可能导致各种后果。它们与人类综合症、神经退行性疾病、免疫缺陷和癌症的发展有关。

为了寻找潜在的 DNA 配体，分析了 PDB 和 PDBe 配体中所有可用的 DNA 结构。然后选择了以下条目进行计算机筛选：5W77、6JJ0、7KBW、5T4W、6IJW、7KWK、5Z80、6CCW、6SX3 和 7EL7。在寻找潜在配体时，主要采用了两种结合类型的方法：

• 插入：配体自身插入堆叠的 DNA 碱基对之间。

• 在 DNA 沟槽内结合：配体与 DNA 沟槽结合，而不会显著破坏 DNA 结构。

分子对接模拟使用了以下查询方式：氢键受体和氢键供体的药效团模型，芳香族基团，硬脂酸和体积排斥特征。每个药效团模型都包括共同特征和特定特征，使结合点特异于每个 DNA 靶结构及其相应的天然配体。下面提供了几个例子。