别构 GPCR 化合物库
专为发现新型别构配体而设计
14 160 种化合物
尽管用正构选择性候选药物调节 GPCR 的成功案例不胜枚举,但在许多情况下,别构 GPCR 配体对这些生物靶点更为有效。小分子对 GPCR 的别构调控可以促使受体发生构象变化,这种变化通常不会产生明显效应,但在正构内源性配体存在的情况下,会对信号传导途径产生强烈影响。另一方面,由难以处理的刺激所激活的 GPCR 可通过别构调控进行调节,从而为目前尚无法攻克的靶点开辟新的机遇。两种已应用于临床的 GPCR 别构调节剂(Cinacalcet 和 Maraviroc)充分证明了这一领域的研究前景。与大多数正构配体相比,这些配体的另一个优点是分子量相对较低,因此口服生物利用度更高。此外,别构位点通常不太保守,这使得有可能开发出具有更高亚型选择性的活性化合物,而不是针对保守结合位点的药物。
Enamine 的别构 GPCR 库是药物发现领域中别构 GPCR 调节剂研究的一个有用的起点。
典型格式
别构 GPCR 化合物库可以提供各种预装板(pre-plated)格式,包括以下最受欢迎的几种:
目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
AGR-14-0-Z-10 | 14 160 12块板 |
≤300nL@10mM DMSO溶液 |
1536孔Echo LDV微孔板 前4列和后4列留空,每板1280个化合物 |
立即询价 |
AGR-14-10-Y-10 | 14 160 45块板 |
≤10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔LDV微孔板,Echo认证#001-12782 (LP-0200) 前2列和后2列分别留空,每板320个化合物 |
立即询价 |
AGR-14-50-Y-10 | 14 160 45块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
384孔板(Greiner Bio-One plates #781280) 第1、2和23、24列留空,每板320个化合物 |
立即询价 |
化合物库 & 后续跟进包: | AGR-14-10-Y-10 筛选库 14 160 个化合物 hit 再补给,类似物从 440 多万库存中获取或从 REAL 空间合成 |
* 我们很乐意以最方便您项目的格式提供我们的化合物库。请在以下我们标准的微孔板中进行选择:Greiner Bio-One 781270、784201、781280、651201 或 Echo Qualified 001-12782 (LP-0200)、001-14555 (PP-0200)、001-6969 (LP-0400)、C52621,或者您可以提供您偏好的实验器具。如需化合物混合池,我们也可以根据要求提供。
库的设计
在化合物库的设计中使用了基于配体和基于结构的方法。基于配体的方法依赖于使用 3D 药效团搜索,针对一组已知具有高活性值的配体(来自 ChEMBL 和 BindingDB 数据库的超过 200 种化合物)。主要关注于已在药物发现中得到确认的 B 类 GPCR 的别构调节剂。我们创建了两个药效团模型,使用了一组参考化合物,并通过训练集中的活性和非活性配体进行了验证(图1)。最终,从 Enamine 的 MedChem 集(71 万个小分子)中筛选出 6 200 个小分子,将其纳入基于药效团的别构 GPCR 子集。
图1.参考活性化合物(绿色)和库中的 hit 化合物(灰色)的药效团叠加。
基于结构的方法应用于人类胰高血糖素受体(GCGR)和人类促肾上腺皮质激素释放因子 1 受体(CRF1R)。相应的蛋白质结构记录在 PDB 条目 5EE7 和 4K5Y 中,并进行了优化,用于与 Glide(Schrödinger 软件)进行对接计算。选择得分至少为与共晶配体 50% 效能的化合物作为命中化合物,并将它们包含在靶向集合中:h-GCGR 集合—— 200 个化合物;h-CRF1R 集合:7200 个化合物(图2和图3)。
图2.人胰高血糖素受体(GCGR)中 hit(红色)的结合模式与共结晶配体(绿色)的比较。
图3.人促肾上腺皮质激素释放因子 1 受体(CRF1R)别构位点对接后的 hit(绿色)与共结晶配体 CP-376395(橙色)的叠加。